朱氏宗祠是区级文物保护单位，位于琅岐岛牛屿山西麓，背山临街，祠面宽11.5米，纵深69米，建筑面积865.5平方米，祠构堂皇，四周烽火高墙，飞檐包脊，青瓦盖顶。大门两旁镌文《朱子家训》，《朱伯庐格言》，显示琅山朱氏崇尚理学；门口左右石鼓，祠前一对石狮对峙。双斗旗杆高竖，显耀琅山朱氏历代辉煌。
祠为三进，步步登高，层层仰止。殿堂均为穿斗抬梁木构，保持明朝建筑风格。大厅悬挂“敦厚堂”匾额，显示琅山朱氏倡导忠良孝友，敦亲睦邻。大厅正上有精美牌位阁楼，放琅山朱氏历代先祖于族人牌位，于祖先画像。祠内楹联均为琅山朱氏后裔所撰，书法名家书写；大厅与回廊悬挂朱熹手迹木刻和诸多书华，文化氛围浓厚。祠前建有照墙；祠后辟有紫阳公园，颇有特色。
琅山朱氏是唐宰相朱敬则后裔，朱敬则被尊为琅山朱氏始祖。唐宋史料`福建官方档案`琅山朱氏古族谱均记载琅山朱氏源于河南永城，乃朱操次子朱敬则后裔。入闽有一千一百余载，入闽始祖乃朱敬则七世裔孙唐户部尚书朱光启；迁琅八百余载。始祖乃朱光启十二世裔孙南宋宰相朱倬；迁琅山始祖乃朱倬曾孙朱君美。迁琅山以来已传二十五世，后裔一万有余。碑刻记载，琅山朱氏宗祠始建于大明宣德十年（1435年）由琅山朱氏二十五世祖朱奎发动族人修建；大明崇祯八年（1635）由琅山朱氏三十世祖朱明庭出资重修；沦陷九十一年（1736年）再一次重修；民国三十五年（1946年）再次重修；共和国十八年（1966年）红卫兵摧毁祠堂朱氏历代祖先总谱，牌位，画像等。祠堂被充为公家仓库，琅岐供销社堆放农资化肥，加上年久失修，墙恒秃坏，木构腐烂，面临倒塌，因祠堂被公家占用，族人无能为力。八十年代朱氏族人向政府讨回琅山朱氏宗祠，后加以小规模固定修复。共和国四十九年（1997年）旅居台湾的朱敬则四十世裔孙朱立容（国内外著名经济学家）还乡探亲祭祖，撰诗“恋家乡”，盼“统一”向福建省人民政府捐献几百万人民币于教育方面，被育为“乐育英才”。号召族人重建祠堂，并捐资80万，在他带头下，琅山朱氏后裔纷纷捐款二百余万，共三百余万。共和国四十九年（1997年）农历八月动工，于共和国五十一年（1999年）五月竣工。经精心设计施工，宗祠更焕异彩。共和国五十八年（2006年）琅山朱氏族谱续谱结束，每户发放一本新族谱，古支谱与君美公墓出土的南宋世系谱牒安留在祠堂。